Д. И. Менделеев —

• доктор Туринской Академии наук (1893),

• доктор Кембриджского университета (1894),

• доктор химии Санкт-Петербургского университета (1865),

• доктор права Эдинбургского университета (1884),

• доктор права Принстонского (1896) университета,

• доктор права университета Глазго (1904),

• доктор гражданского права Оксфордского университета (1894),

• доктор философии и магистр свободных искусств Гёттингенского университета (1887);

• член Лондонского королевского общества содействия естественным наукам (1892),

• член Эдинбургского королевского общества (1888),

• член Дублинского королевского общества (1886);

• член Римской академия наук (Accademia dei Lincei, 1893),

• член Королевской академии наук Швеции (1905),

• член Американской академии искусств и наук (1889),

• иностранный член Национальной академии наук Соединённых Штатов Америки (Бостон, 1903),

• член Датской королевской Академии наук (Копенгаген, 1889),

• член Ирландской королевской академии (1889),

• член Юго-Славянской академия наук (Загреб),

• член Чешской академии наук, литературы и искусства (1891),

• член Краковской академия наук (1891),

• член Бельгийской академии наук, литературы и изящных искусств (accocié, 1896);

• член Академии художеств (Санкт-Петербург, 1893);

• почётный член Королевского института Великобритании (1891);

• член-корреспондент Санкт-Петербургской академии наук (1876),

• член Парижской академия наук (1899),

• член Прусской академия наук (1900),

• член Венгерской академия наук (1900),

• член Болонской академия наук (1901),

• член Сербской академия наук (1904);

• почётный член МГУ (1880),

• почётный член Киевского университета (1880),

• почётный член Казанского университета (1880),

• почётный член Харьковского университета (1880),

• почётный член Новороссийского университета (1880),

• почётный член Юрьевского университета (1902),

• почётный член Санкт-Петербургского университета (1903),

• почётный член Томского университета (1904);

• почётный член Института сельского хозяйства и лесоводства в Новой Александрии (1895),

• почётный член Санкт-Петербургского технологического института (1904),

• почётный член Санкт-Петербургского политехнического института,

• почётный член Санкт-Петербургской медико-хирургической академии (1869),

• почётный член Петровской земледельческой и лесной академии (1881),

• почётный член Московского технического училища (1880).

Д. И. Менделеева также избрали своим почётным членом:

• Русское физико-химическое общество (1880),

• Русское техническое общество (1881),

• Русское астрономическое общество (1900),

• Санкт-Петербургское минералогическое (1890) общество,

• ещё около 30 сельскохозяйственных, медицинских, фармацевтических и других российских обществ — самостоятельных и университетских;

• Общество биологической химии (Международное объединение для содействия исследованиям, 1899),

• Общество естествоиспытателей в Брауншвейге (1888),

• Английское химическое общество (1883),

• Американское химическое общество (1889),

• Немецкое химическое общество (1894),

• Физическое общество во Франкфурте-на-Майне (1875),

• Общество физических наук в Бухаресте (1899),

• Фармацевтическое общество Великобритании (1888),

• Филадельфийский фармацевтический колледж (1893),

• Королевское общество наук и литературы в Гётеборге (1886),

• Манчестерское литературно-философское общество (1889),

• Кембриджское философское общество (1897),

• Королевское философское общество в Глазго (1904),

• Научное общество Антонио Альцате (Мехико, 1904),

• Международный комитет мер и весов (1901)

и многие другие отечественные и зарубежные научные учреждения.

Учёный удостоен:

• медали Дэви Лондонского королевского общества (1882),

• медали Академии метеорологической аэростатики (Париж, 1884),

• Фарадеевской медали Английского химического общества (1889),

• медали Копли Лондонского королевского общества (1905)

и многих других наград.